《中國藥用植物志》編寫的定位是介紹中圍藥用植物資源和準確鑒定藥用植物的種類（亞種、變種和變型）的工具書，同時反映各種藥用植物的現(xiàn)代化學、藥理和藥材等方面的研究成果和資料，因此編寫項目的設定和要求、給出的圖像和圖版、引證的文獻均符合上述目的。
　　《中國藥用植物志》收載有文獻記載的中國藥用植物12000余種（包括種下分類群），分13卷出版，其中前12卷為正篇，每卷收載1000種左右，每卷后附有該卷收錄的藥用植物中文名與拉丁名索引；第13卷附篇名為《中國藥用植物志詞》，匯編了本志收錄的藥用植物相關學科的專業(yè)詞匯，兼作綜合索引，內容包括全書收載的藥用植物中文名稱索引、拉丁名稱索引、英文名稱索引、中拉英名稱互譯、化學成分的中英文名稱互譯及其原植物來源等，使其既可作為閱讀藥用植物的科技文獻工具書使用，又可方便查到正篇中詞匯的出處。
　　《中國藥用植物志》收載的種類主要為高等植物，亦收集了重要的藥用藻類、真菌與地衣。高等植物科的順序排列：苔蘚類采用陳邦杰（1972）的順序，蕨類植物采用秦仁昌分類系統(tǒng)（1978），裸子植物采用鄭萬鈞分類系統(tǒng)（1978），被子植物采用恩格勒分類系統(tǒng)（1964）（個別科有調整）。低等植物中藥用種類較少，依照《中國中藥資源志要》（1994）順序排列，科特征和屬、種檢索表從略。
　　高等植物每個科下為總論，主要包括三部分內容。*部分介紹科的簡要特征，其中還包括本科植物世界分布的屬和種的數(shù)目、在我國分布的屬和種的數(shù)目以及在國內分布的藥用屬和種的數(shù)目；第二部分概括性敘述該科特征性化學成分和主要活性成分及其作用；第三部分為國內本科具有藥用種類的屬的分屬檢索表。
　　對每個屬，簡要記述屬的形態(tài)特征，綜述屬的特征性化學成分和活性成分（或部位），重要的結構類型給出化學結構式，同時扼要地介紹本屬植物相同或近似的藥理作用。屬的記述后給出該屬藥用植物分種檢索表。
　　藥用植物種的記述分重點記述、一般記述兩種形式，常用的藥用植物作重點記述。
　　每種藥用植物的記載內容包括：中文名（除正名外還應包括別名、地方習用名或民族藥名）、拉丁學名（除正名外還應引證基名和藥學文獻中常用的異名。正名后引用以該學名發(fā)表的原始文獻，寫法參照《中國植物志》，異名的原文獻略去）、英文名、習性形態(tài)、分布與生境、藥用部位、功效應用、化學成分、藥理作用、毒性及不良反應、注評和參考文獻等項，或其中幾項。為了方便鑒定，給出該植物墨線圖，并在能收集到的情況下給出原植物和原藥材的照片。
　　中文正名一般采用《中國植物志》或《中華人民共和國藥典》（2010年版）的所載名為正名，用黑體字排印。別名用白體字排印，一般不超過5個，個別使用地區(qū)廣泛的藥用植物，別名有可能超過5個。