而且全身感覺、運動傳導束皆通過于此，呼吸、循環(huán)中樞亦位腦干下方的延髓內，其內的網狀結構是參與維持意識清醒的重要結構。因此腦干損傷后，除了有顱神經的功能障礙外，意識、運動、感覺的障礙往往較重，可導致呼吸、循環(huán)功能的衰竭，危及生命。
    1.意識障礙：原發(fā)性腦干損傷的典型表現為受傷后立即出現持續(xù)性的昏迷，輕者對痛刺激有反應，重者昏迷程度深，甚至可致生命體征紊亂。中腦損傷，網狀結構受損嚴重，多表現為程度不同的意識障礙。腦橋損傷，可致持久的意識喪失，恢復慢，甚至植物生存狀態(tài)。
    2.呼吸、循環(huán)功能紊亂：中腦內有側視中樞，中腦損傷可導致凝視麻痹，頭眼水平運動反射消失等。呼吸節(jié)律調節(jié)中樞和長吸中樞位于腦橋內，腦橋損傷易導致呼吸紊亂、節(jié)律不齊、或抽泣樣呼吸。延髓內的吸氣和呼氣中樞受損時，導致呼吸抑制和循環(huán)紊亂，呼吸緩慢、間斷，心率快弱、血壓下降，心眼反射消失。因此，原發(fā)性腦干損傷，特別是腦橋、延髓損傷后，可產生急性呼吸功能衰竭，傷后出現自主呼吸立即停止，或者出現呼吸先深而快，而后深而慢，不規(guī)則，直至完全停止。同時，循環(huán)功能亦出現衰竭表現，但比呼吸衰竭程度輕。當呼吸停止后，心跳尚可維持數小時或數日。如及時搶救，呼吸機維持呼吸，心跳可維持數小時或數日，但已屬腦死亡狀態(tài)。繼發(fā)性腦干損傷，出現的呼吸、循環(huán)衰竭呈逐漸演變的過程，早期有中樞性代償，表現為血壓升高、脈搏緩而有力、呼吸深快。隨著損害加重，表現為血壓下降、脈搏細速、呼吸慢而不規(guī)則的失代償表現，直至呼吸心跳停止。