目前，執(zhí)行地表水（環(huán)境）功能區(qū)劃和國家地表水環(huán)境質(zhì)量標準是我國區(qū)域性水環(huán)境管理的主要手段，以此為核心圍繞水質(zhì)目標、水環(huán)境功能區(qū)達標制定水環(huán)境管理的策略和方法，在解決我國水資源管理、水污染控制等方面發(fā)揮了重要作用，卻難以滿足恢復和保護流域生態(tài)系統(tǒng)健康的需求，特別是對物種和種群的保護、棲息地的恢復、濕地的保護、生態(tài)容量、水陸統(tǒng)籌管理等，缺乏行之有效的管理手段。
　　2015年9月，中共中央、國務院印發(fā)《生態(tài)文明體制改革總體方案》，明確提出要樹立山水林田湖是一個生命共同體的理念，按照生態(tài)系統(tǒng)的整體性、系統(tǒng)性及其內(nèi)在規(guī)律，統(tǒng)籌考慮自然生態(tài)各要素，進行整體保護、系統(tǒng)修復、綜合治理，增強生態(tài)系統(tǒng)循環(huán)能力，維護生態(tài)平衡。2015年4月，國務院出臺《水污染防治行動計劃》，其中第二十五條深化重點流域污染防治明確提出研究建立流域水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)管理體系。
　　水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)，是依據(jù)河流生態(tài)學中的格局與尺度理論，反映流域水生態(tài)系統(tǒng)在不同空間尺度下的分布格局，基于流域水生態(tài)系統(tǒng)空間特征差異，結合人類活動影響因素而提出的一種分區(qū)方法。它是水環(huán)境管理從水質(zhì)目標管理向水生態(tài)健康管理拓展的基礎管理單元，是確定流域水生態(tài)保護與水質(zhì)管理目標的基礎。國家水體污染控制與治理科技重大專項在十一五期間開展了水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)研究，完成了全國十大流域水生態(tài)一級、二級分區(qū)的劃分，并重點劃分了太湖、遼河兩大流域三級分區(qū)；十二五期間在太湖流域又進一步開展了三級水生態(tài)功能分區(qū)的示范與應用研究。
　　為了推進江蘇省生態(tài)文明建設，改善流域水環(huán)境質(zhì)量，加強流域水生態(tài)環(huán)境保護，保障流域水生態(tài)系統(tǒng)健康，在之前研究成果基礎上，進一步結合江蘇省實際情況，通過對太湖流域水文一水質(zhì)一水生態(tài)的系統(tǒng)調(diào)查、水生態(tài)健康指數(shù)指標體系的建立、流域重要保護物種的研究，在太湖流域（江蘇）劃分了49個水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)，對各生態(tài)分區(qū)的生態(tài)功能與服務功能的判別，制定了三類四級水生態(tài)管控目標，初步構建了太湖流域（江蘇）分區(qū)、分級、分類、分期水生態(tài)健康管理體系，進而推進江蘇省環(huán)境管理實現(xiàn)四個轉變：從保護水資源的利用功能向保護水生態(tài)服務功能轉變，從單一水質(zhì)目標管理向水質(zhì)、水生態(tài)雙重管理轉變，從目標總量控制向容量總量控制轉變，從水陸并行管理向水陸統(tǒng)籌管理轉變，促進流域水生態(tài)系統(tǒng)健康與社會經(jīng)濟協(xié)調(diào)可持續(xù)發(fā)展。
　　該項工作始于水專項研究，但也受到了江蘇省環(huán)保廳領導的高度重視，研究成果多次征詢了環(huán)保部原污防司、江蘇省各相關部門、太湖流域各地市政府、太湖流域各地市環(huán)保系統(tǒng)以及江蘇省太湖流域水污染防治辦公室相關領導和專家的意見和建議，目前己融入江蘇省環(huán)保廳的行政管理工作之中。成果為地方政府建立了一套基于水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)的流域水生態(tài)健康管理體系，實現(xiàn)了與現(xiàn)有水環(huán)境管理日常工作的并軌運行。研究形成的水生態(tài)管理、空間管控和物種保護三大類目標將分為分近、遠期實施，指導地方政府對水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)進行考核與管理，進而為江蘇省太湖流域的水環(huán)境、水生態(tài)管理、各區(qū)域制定社會經(jīng)濟發(fā)展規(guī)劃、環(huán)境管理制度等工作提供基礎依據(jù)，為江蘇省太湖流域水環(huán)境管理決策提供基礎支撐，促進環(huán)境與經(jīng)濟發(fā)展相協(xié)調(diào)，保障生態(tài)系統(tǒng)健康與經(jīng)濟可持續(xù)發(fā)展，最終實現(xiàn)推動流域污染物總量減排，水質(zhì)改善、水生態(tài)健康的目標。
　　本書是國家水體污染控制與治理科技重大專項太湖流域（江蘇）水生態(tài)功能分區(qū)與標準管理工程建設課題太湖流域（江蘇）水生態(tài)功能分區(qū)管理示范子課題（編號：2012ZX07506-001-001）研究成果的總結。感謝江蘇省環(huán)境保護廳、中國科學院南京地理與湖泊研究所、中國環(huán)境科學研究院、江蘇省環(huán)境監(jiān)測中心等單位領導與同行的幫助，在此一并表示感謝。
　　由于編者學術水平有限，書中難免存在差錯、遺漏等諸多不足之處，敬請學術界同行與廣大讀者批評指正。