目錄
第1章 緒論 1
1.1 青枯雷爾氏菌及青枯病的發(fā)生與分布 1
1.2 煙草青枯病及青枯雷爾氏菌 3
1.3 影響青枯病發(fā)生的微生態(tài)因素 4
1.4 調(diào)查研究方法 6
1.4.1 病株采集標(biāo)準(zhǔn)及方法 6
1.4.2 菌株的分離和純化 7
1.4.3 菌株的分類鑒定 7
1.4.4 土樣采集 8
1.4.5 土樣分析方法 8
第2章 全國(guó)煙草青枯雷爾氏菌的遺傳信息分析 10
2.1 全國(guó)煙草青枯雷爾氏菌的遺傳多樣性分析 10
2.1.1 全國(guó)煙草青枯雷爾氏菌的生化變種鑒定 10
2.1.2 全國(guó)煙草青枯雷爾氏菌的演化型鑒定 11
2.1.3 全國(guó)煙草青枯雷爾氏菌的系統(tǒng)發(fā)育分析 11
2.1.4 煙草青枯雷爾氏菌序列變種的分布 14
2.2 重慶彭水菌株CQPS-1的全基因組完成圖測(cè)序 15
2.2.1 測(cè)序菌株CQPS-1的相關(guān)采集信息 15
2.2.2 測(cè)序菌株CQPS-1的分類地位及生長(zhǎng)特性 16
2.2.3 菌株CQPS-1全基因組的基本信息 16
2.2.4 菌株CQPS-1基因組組分分析 17
2.2.5 菌株CQPS-1基因組注釋 19
2.2.6 比較基因組分析 20
2.3 全國(guó)煙草青枯雷爾氏菌菌株的基因組測(cè)序 24
2.3.1 全國(guó)煙草青枯菌菌株基因組測(cè)序及變異分析 25
2.3.2 全國(guó)煙草青枯菌測(cè)序菌株基因組的組裝與分析 28
2.3.3 基于基因組的全國(guó)煙草青枯菌菌株遺傳進(jìn)化關(guān)系 31
第3章 福建煙區(qū) 34
3.1 福建省三明市 34
3.1.1 建寧縣 34
3.1.2 泰寧縣 37
3.1.3 寧化縣 41
3.1.4 永安市 44
3.2 福建省南平市 48
3.2.1 建陽區(qū) 48
3.2.2 邵武市 51
3.3 福建省龍巖市 55
3.3.1 永定區(qū) 55
3.3.2 武平縣 58
第4章 廣東煙區(qū) 64
4.1 廣東省梅州市 64
4.1.1 蕉嶺縣 64
4.1.2 五華縣 67
4.2 廣東省韶關(guān)市 70
4.2.1 南雄市 70
第5章 江西煙區(qū) 75
5.1 江西省贛州市 75
5.1.1 瑞金市 75
5.1.2 信豐縣 78
5.1.3 石城縣 82
5.2 江西省撫州市 83
5.2.1 廣昌縣 83
第6章 廣西煙區(qū) 88
6.1 廣西壯族自治區(qū)百色市 88
6.1.1 靖西市 88
6.1.2 隆林各族自治縣 91
6.2 廣西壯族自治區(qū)賀州市 95
6.2.1 鐘山縣 95
6.2.2 富川瑤族自治縣 99
6.3 廣西壯族自治區(qū)河池市 102
6.3.1 南丹縣 102
第7章 湖南煙區(qū) 108
7.1 湖南省郴州市 108
7.1.1 桂陽縣 108
7.2 湖南省湘西土家族苗族自治州 111
7.2.1 龍山縣 111
7.2.2 花垣縣 115
7.2.3 鳳凰縣 118
第8章 四川煙區(qū) 124
8.1 四川省宜賓市 124
8.1.1 興文縣 124
8.1.2 筠連縣 127
8.2 四川省瀘州市 130
8.2.1 古藺縣 130
8.3 四川省攀枝花市 134
8.3.1 米易縣 134
8.4 四川省涼山彝族自治州 137
8.4.1 德昌縣 137
8.4.2 冕寧縣 141
第9章 安徽煙區(qū) 147
9.1 安徽省蕪湖市 147
9.1.1 南陵縣 147
9.2 安徽省宣城市 150
9.2.1 宣州區(qū)文昌鎮(zhèn) 150
9.2.2 宣州區(qū)黃渡鄉(xiāng) 154
第10章 云南煙區(qū) 159
10.1 云南省曲靖市 159
10.1.1 羅平縣 159
10.2 云南省文山壯族苗族自治州 162
10.2.1 麻栗坡縣 162
10.2.2 西疇縣 166
10.3 云南省保山市 169
10.3.1 騰沖市 169
10.3.2 龍陵縣 172
10.4 云南省臨滄市 176
10.4.1 永德縣 176
10.4.2 臨翔區(qū) 179
10.5 云南省普洱市 182
10.5.1 景谷傣族彝族自治縣 182
10.6 云南省昆明市 186
10.6.1 石林彝族自治縣 186
第11章 貴州煙區(qū) 191
11.1 貴州省貴陽市 191
11.1.1 開陽縣 191
11.2 貴州省黔西南布依族苗族自治州 194
11.2.1 興仁縣 194
11.3 貴州省遵義市 198
11.3.1 綏陽縣 198
11.3.2 正安縣 201
11.4 貴州省銅仁市 204
11.4.1 德江縣 204
11.4.2 石阡縣 208
11.5 貴州省黔東南苗族侗族自治州 211
11.5.1 天柱縣 211
11.6 貴州省黔南布依族苗族自治州 214
11.6.1 甕安縣 214
11.6.2 福泉市 217
11.6.3 獨(dú)山縣 220
第12章 重慶煙區(qū) 226
12.1 武隆區(qū) 226
12.2 彭水苗族土家族自治縣 229
12.3 黔江區(qū) 233
12.4 涪陵區(qū) 237
12.5 豐都縣 241
12.6 石柱縣 245
12.7 酉陽土家族苗族自治縣 248
12.8 南川區(qū) 251
12.9 萬州區(qū) 252
12.10 奉節(jié)縣 253
第13章 湖北煙區(qū) 257
13.1 湖北省恩施土家族苗族自治州 257
13.1.1 咸豐縣 257
13.1.2 鶴峰縣 260
第14章 陜西煙區(qū) 266
14.1 陜西省漢中市 266
14.1.1 西鄉(xiāng)縣 266
第15章 山東煙區(qū) 270
15.1 山東省濰坊市 270
15.1.1 諸城市 270
15.2 山東省臨沂市 273
15.2.1 沂水縣 273
第16章 河南煙區(qū) 279
16.1 河南省駐馬店市 279
16.1.1 確山縣 279
參考文獻(xiàn) 281
結(jié)語 283