第1章 緒論 001～012
1.1 微生物概述 002
1.1.1 微生物的基本概念 002
1.1.2 微生物的主要分類 002
1.1.3 微生物的分類系統(tǒng) 004
1.1.4 微生物的主要分布 005
1.2 現(xiàn)代微生物學概述 006
1.2.1 現(xiàn)代微生物學的研究領(lǐng)域 006
1.2.2 現(xiàn)代微生物學的研究方向 007
1.2.3 現(xiàn)代微生物學的研究方法 008
1.3 微生物菌群生態(tài)與環(huán)境和人類健康 009
1.3.1 微生物菌群生態(tài)的基本內(nèi)涵 009
1.3.2 微生物菌群生態(tài)與環(huán)境 010
1.3.3 微生物菌群生態(tài)與人類健康 011
參考文獻 012

第2章 微生態(tài)平衡與人類健康 013～022
2.1 微生態(tài)與微生態(tài)平衡 014
2.1.1 微生態(tài)研究的意義 014
2.1.2 微生態(tài)平衡及主要標志 015
2.1.3 微生態(tài)平衡失調(diào)及主要標志 016
2.2 微生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)與功能 017
2.2.1 微生態(tài)系統(tǒng) 017
2.2.2 微生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)與結(jié)構(gòu)層次 018
2.2.3 人體微生態(tài)系統(tǒng)的功能與功能層次 020
參考文獻 021

第3章 腸道微生物概述 023～030
3.1 腸道微生物分類 024
3.2 腸道微生物與人類健康 024
3.2.1 腸道微生物的功能 024
3.2.2 腸道微生物的影響因素 025
3.3 腸道微生物的應用現(xiàn)狀與發(fā)展前景 026
3.3.1 腸道微生物的應用現(xiàn)狀 026
3.3.2 腸道微生物的發(fā)展前景 028
參考文獻 029

第4章 腸道微生物的生態(tài)學基礎(chǔ) 031～045
4.1 腸道微生物入侵 032
4.2 腸道微生物多樣性 036
4.3 腸道微生物與宿主間的互利共生 038
4.4 腸道微生物功能與代謝研究 039
4.5 腸道微生物間的競爭 041
參考文獻 044

第5章 腸道微生物的研究方法 046～083
5.1 腸道微生物研究策略、方法與主要內(nèi)容 047
5.1.1 腸道微生物研究策略 047
5.1.2 腸道微生物研究方法 048
5.1.3 腸道微生物研究內(nèi)容 049
5.2 高通量測序技術(shù)的發(fā)展與腸道菌群研究 049
5.2.1 第一代測序技術(shù) 051
5.2.2 第二代測序技術(shù) 052
5.2.3 第三代測序技術(shù) 053
5.3 腸道菌群組成結(jié)構(gòu)的研究方法 055
5.3.1 16S rRNA基因測序技術(shù) 055
5.3.2 全基因組測序技術(shù) 056
5.3.3 宏基因組測序技術(shù) 058
5.3.4 宏轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù) 061
5.4 腸道菌群功能的研究方法 063
5.4.1 宏基因組測序技術(shù) 063
5.4.2 代謝組學測序技術(shù) 064
5.4.3 基因組學測序技術(shù) 066
5.4.4 轉(zhuǎn)錄組學測序技術(shù) 068
5.5 腸道菌群與宿主相互作用的研究方法 070
5.6 腸道菌群與疾病關(guān)系的研究方法 074
5.7 腸道菌群調(diào)控的研究方法 075
5.8 腸道菌群代謝物的研究方法 077
5.8.1 16S rRNA基因測序技術(shù) 078
5.8.2 全基因組測序技術(shù) 079
5.8.3 代謝組學測序技術(shù) 079
5.8.4 核磁共振波譜技術(shù) 079
參考文獻 081

第6章 腸道菌群與代謝類疾病、消化類疾病、神經(jīng)類疾病的關(guān)系 084～114
6.1 腸道菌群與代謝類疾病的關(guān)系 085
6.1.1 代謝類疾病概述 085
6.1.2 腸道菌群與肥胖 085
6.1.3 腸道菌群與糖尿病 087
6.1.4 腸道菌群與高血壓 089
6.1.5 腸道菌群與高脂血癥 090
6.2 腸道菌群與消化類疾病的關(guān)系 091
6.2.1 消化類疾病概述 091
6.2.2 腸道菌群與腸易激綜合征 093
6.2.3 腸道菌群與炎癥性腸病 094
6.2.4 腸道菌群與腸道感染 096
6.2.5 腸道菌群與脂肪肝、肝硬化 098
6.3 腸道菌群與神經(jīng)類疾病 104
6.3.1 腸道菌群與精神障礙 105
6.3.2 腸道菌群與帕金森病 107
6.3.3 腸道菌群與腦血管病 108
6.3.4 腸道菌群與孤獨癥譜系障礙 110
參考文獻 112

第7章 腸道菌群與人體免疫性疾病 115～123
7.1 腸道菌群與人體免疫性疾病的關(guān)系 116
7.2 腸道菌群與自身免疫性疾病 117
7.3 腸道菌群與過敏性疾病 119
7.4 腸道菌群與免疫缺陷性疾病 120
參考文獻 122

第8章 益生菌與人類健康 124～134
8.1 益生菌的基本內(nèi)涵 125
8.1.1 益生菌的定義及主要作用 125
8.1.2 益生菌的主要分類 125
8.1.3 益生菌的基本特性 126
8.2 益生菌的分布規(guī)律 127
8.2.1 益生菌在腸道中的分布規(guī)律 127
8.2.2 益生菌在不同發(fā)育時期的分布規(guī)律 128
8.3 腸道益生菌的平衡與失調(diào) 129
8.3.1 腸道益生菌的平衡 129
8.3.2 影響腸道益生菌平衡的主要因素 130
8.3.3 腸道益生菌平衡失調(diào)與疾病的關(guān)系 130
8.4 益生菌的作用機理與發(fā)展前景 131
參考文獻 133

第9章 飲食與腸道菌群 135～145
9.1 飲食與腸道菌群的關(guān)系 136
9.2 膳食纖維與腸道菌群 136
9.3 營養(yǎng)物質(zhì)代謝與腸道菌群 139
9.4 飲食習慣與腸道疾病預防 141
參考文獻 144

后記 146～147