本書講述了小男孩乘上一列不可思議的人體探險列車，開始在自己身體內冒險的故事。他跟隨人體探險列車，先是鉆進過山車一般的“食道隧道”，駛上長長的“小腸公路”，接著穿過硝煙四起的“大腸干道”，細菌們在這里展開著激烈的戰(zhàn)斗。