本書將以核酸(DNA和RNA)與抗腫瘤抗病毒藥物小分子的相互作用為主線,分專題介紹該領(lǐng)域中最新的研究進展。并對研究核酸與小分子的相互作用時所采用的新的理論和技術(shù)包括生物芯片技術(shù)、生物傳感技術(shù)、生物微量熱技術(shù)、細胞高內(nèi)涵分析技術(shù)及計算機分子對接技術(shù),結(jié)合常規(guī)的、傳統(tǒng)的分子生物學(xué)技術(shù)、波譜學(xué)技術(shù)如多維核磁共振和激光拉曼譜學(xué)技術(shù)進行系統(tǒng)的介紹?傊,本書無論從研究內(nèi)容上還是方法學(xué)上都力求反映當(dāng)代這一領(lǐng)域最新研究進展,其中很多是編者的最新研究成果。
本書是關(guān)于研究“抗腫瘤抗病毒藥物與核酸相互作用的分子機制”方面的專著,書中具體包括了:共價結(jié)合的烷基化試劑與DNA作用的分子機制、稀土元素與核酸的相互作用、小分子干擾RNA的作用途徑與機制、凝膠阻滯實驗研究小分子與DNA的結(jié)合對DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合的影響等內(nèi)容。本書適合從事相關(guān)研究工作的人員參考閱讀。
《抗腫瘤抗病毒藥物與核酸相互作用的分子機制》是關(guān)于研究“抗腫瘤抗病毒藥物與核酸相互作用的分子機制”方面的專著,書中具體包括了:共價結(jié)合的烷基化試劑與DNA作用的分子機制、稀土元素與核酸的相互作用、小分子干擾RNA的作用途徑與機制、凝膠阻滯實驗研究小分子與DNA的結(jié)合對DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合的影響等內(nèi)容。《抗腫瘤抗病毒藥物與核酸相互作用的分子機制》適合從事相關(guān)研究工作的人員參考閱讀。
專論篇
第1章 核酸作為藥物靶標(biāo)的分子基礎(chǔ)
第一節(jié) 藥物分子與DNA的相互作用
一、DNA分子的高級結(jié)構(gòu)特征
二、小分子藥物與DNA的作用方式
第二節(jié) 藥物分子與RNA的相互作用
一、RNA分子的高級結(jié)構(gòu)特征
二、RNA的分子結(jié)構(gòu)與功能研究的黃金時代
第三節(jié) 藥物分子與核酸的相互作用力分析
一、靜電作用
二、氫鍵
三、范德華力
四、疏水作用
第2章 共價結(jié)合的烷基化試劑與DNA作用的分子機制
第一節(jié) DNA的基本反應(yīng)
一、水解反應(yīng)
二、氧化還原反應(yīng)
三、DNA與親電試劑的作用
四、DNA與親核試劑的作用
五、DNA的光化學(xué)反應(yīng)
六、離子化輻射對核酸的影響
第二節(jié) 烷基化藥物與DNA的作用機制和選擇性
一、烷基化試劑的化學(xué)反應(yīng)機制
二、烷基化試劑的作用位點
三、烷基化藥物與DNA作用的選擇性
四、高選擇性的烷基化試劑
第三節(jié) 烷基化作用的DNA損傷
一、DNA損傷的類型
二、抗腫瘤藥物的DNA損傷
三、代謝激活致癌物與DNA的作用
第3章 DNA與抗癌鉑絡(luò)合物相互作用的分子機制
第一節(jié) 順式鉑抗腫瘤藥物的研究
一、第一代鉑類抗癌藥物——順鉑的研究
二、卡鉑與其他第二代鉑類抗癌藥物的研究
三、含有手性胺配體的第三代順鉑類抗癌藥物的研究
第二節(jié) 反式鉑抗腫瘤藥物的研究
第三節(jié) 多核鉑配合物的研究
第四節(jié) 含Pt—S鍵的鉑配合物
第4章 天然核酸斷裂劑的作用機制
第一節(jié) 博萊霉素
一、BLM的結(jié)構(gòu)
二、BLM的功能區(qū)
三、BLM的作用機制
四、BLM衍生物的合成
五、展望
第二節(jié) 烯二炔
一、新致癌菌素
二、生硝霉素和針棘霉素
三、蒽環(huán)類抗生素
四、其他烯二炔抗生素
五、合成的烯二炔
六、展望
第三節(jié) 其他天然核酸斷裂劑
一、鏈黑霉素
二、RNaseA
第5章 合成核酸斷裂劑的作用機制
第一節(jié) 1,10一鄰二氮雜菲一銅(I)絡(luò)合物
一、(OP)2Cu+的結(jié)構(gòu)
二、(OP)2Cu+對DNA的斷裂作用
三、(OP)2Cu+對RNA的斷裂作用
第二節(jié) 其他1,10一鄰二氮雜菲絡(luò)合物
一、對映異構(gòu)體對DNA結(jié)合的影響
二、對DNA的斷裂作用
三、對RNA的斷裂作用
第三節(jié) EDTA—Fe2+絡(luò)合物
一、斷裂機制
二、EDTA—Fe抖衍生物
第四節(jié) 氨基酸與三肽
一、磷;~氨酸
二、甘氨酸一甘氨酸一L一組氨酸(GGH)
三、甘氨酸一L一組氨酸一L一賴氨酸(GHK)
四、L一賴氨酸一L一色氨酸一L一賴氨酸(KWK)
第五節(jié) 其他合成的核酸斷裂劑
一、鈾酰陽離子
二、卟啉
三、其他金屬絡(luò)合物
第6章 稀土元素與核酸的相互作用
第一節(jié) 稀土熒光探針在檢測核酸中的應(yīng)用
一、稀土熒光探針簡介
二、稀土熒光探針在檢測核酸中的應(yīng)用
第二節(jié) 稀土及其配合物對核酸的斷裂作用
一、稀土元素對單核苷酸的斷裂作用
二、稀土離子對環(huán)核苷酸的斷裂作用
三、稀土離子對二聚體核苷酸的斷裂作用
四、稀土離子及其配合物對寡核苷酸及核酸的斷裂作用
第三節(jié) 小結(jié)
第7章 反義寡核苷酸作為基因表達抑制劑的分子機制
第一節(jié) 反義寡核苷酸的作用機制
一、反義寡核苷酸概述
二、反義寡核苷酸的作用機制
第二節(jié) 反義寡核苷酸的化學(xué)修飾與應(yīng)用
一、反義寡核苷酸的設(shè)計及結(jié)構(gòu)改造
二、反義寡核苷酸在抗腫瘤方面的應(yīng)用
第8章 三鏈核酸的分子結(jié)構(gòu)及其反基因策略的分子機制
第一節(jié) 三鏈核酸的分子結(jié)構(gòu)
一、三鏈核酸的形成和分類
二、三螺旋DNA的穩(wěn)定性及影響因素
第二節(jié) 三鏈核酸的生理功能及反基因技術(shù)
一、調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄
二、反基因技術(shù)的應(yīng)用
三、問題與展望
第9章 小分子干擾RNA的作用途徑與機制
第一節(jié) RNA干擾的機制
一、RNAi的機制研究
二、miRNA的發(fā)生及其生理功能
第二節(jié) RNAi在抗腫瘤和抗病毒研究中的應(yīng)用
一、RNAi用于病毒感染的預(yù)防及治療
二、RNAi用于抗腫瘤治療
三、問題與展望
第10章 G一四鏈體核酸的結(jié)構(gòu)及其生物學(xué)功能的分子機制
第一節(jié) DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性及G一四鏈體的結(jié)構(gòu)
一、DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性
二、G一四鏈體DNA(G—qlaadruplex)的結(jié)構(gòu)
第二節(jié) G一四鏈體可能的生物學(xué)功能
一、G一四鏈體與端粒
二、G一四鏈體的其他生物學(xué)功能
三、G一四鏈體結(jié)合蛋白
第三節(jié) G一四鏈體在藥學(xué)中的應(yīng)用
一、以G一四鏈體為靶點的端粒酶抑制劑
二、作為H1V整合酶抑制劑
第ll章病毒轉(zhuǎn)錄調(diào)控RNA為靶的HIV—l抑制劑研究中的分子識別
第一節(jié) HIV的基本結(jié)構(gòu)
第二節(jié) HIV的生命周期
第三節(jié) Tat蛋白和TARRNA作為抗HIV藥物靶點的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)
第四節(jié) 以Tat-TARRNA相互作用為基礎(chǔ)的HIV-1抑制劑
一、以TARRNA的三核苷酸突起區(qū)為靶
二、同時以三核苷酸突起區(qū)和環(huán)區(qū)為靶
三、僅以TARRNA的環(huán)區(qū)為靶
四、以Tat蛋白為靶
五、反義核酸類擬肽類抑制劑
第12章 小分子藥物與DNA作用的特異性研究
第一節(jié) 小分子藥物與DNA作用的堿基特異性
第二節(jié) 小分子藥物與DNA作用的序列特異性
一、研究藥物與DNA共價結(jié)合序列特異性的方法
二、研究藥物與DNA非共價結(jié)合序列特異性的方法
三、研究有DNA斷裂活性的藥物與DNA作用序列特異性的方法
四、利用序列膠獲得藥物與DNA相互作用的動力學(xué)數(shù)據(jù)
五、提高藥物與DNA作用序列特異性的方法一藥物一寡核苷酸偶合物設(shè)計
方法與技術(shù)篇
第13章 計算機技術(shù)在小分子與生物靶相互作用中的應(yīng)用
第14章 小分子化合物作為探針研究DNA的結(jié)構(gòu)
第15章 凝膠阻滯實驗研究小分子與DNA的結(jié)合對DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合的影響
第16章 表面等離子共振技術(shù)
第17章 熒光染色與熒光探針技術(shù)
第18章 高內(nèi)涵篩選分析技術(shù)
第19章 新型核苷酸的合成與核酸標(biāo)記在基因芯片技術(shù)中的應(yīng)用
第20章 毛細管電泳在藥物與核酸相互作用研究中的應(yīng)用
第21章 拉曼光譜技術(shù)在核酸與小分子相互作用研究中的應(yīng)用
第22章 NMR技術(shù)在小分子藥物與核酸相互作用中的應(yīng)用
第23章 小分子與生物靶分子相互作用的化學(xué)熱力學(xué)研究技術(shù)
第24章 其他研究DNA與小分子作用的實驗方法
索引
專論篇
第1章 核酸作為藥物靶標(biāo)的分子基礎(chǔ)
由沃森和克里克所提出的DNA雙螺旋模型結(jié)構(gòu)奠定了現(xiàn)代生物學(xué)的基礎(chǔ)。隨著時間的推移,核酸在生物學(xué)蓬勃發(fā)展中的重要作用越來越引人注目,核酸的分子生物學(xué)研究亦越來越富有魅力,對核酸結(jié)構(gòu)與功能的研究不僅為生物學(xué)帶來一系列新的發(fā)現(xiàn):如遺傳密碼的闡明、核酸內(nèi)切酶的發(fā)現(xiàn)、核酸合成和序列分析、基因重組技術(shù)的建立等,也為其他自然科學(xué)的發(fā)展作出了貢獻。特別是近年來核酸的研究有了驚人的突破,三十多年來,核酸研究領(lǐng)域的科學(xué)家先后16次獲得諾貝爾獎,足以說明其發(fā)展之迅速。這些科學(xué)家所取得的巨大科研成果有力地推動了核酸三維結(jié)構(gòu)在遺傳信息方面的進展。縱觀核酸在遺傳信息中的作用研究進展,使我們有了一個最基本的認識,即當(dāng)前的分子生物學(xué)是在一個模型、一個法則和四個概念的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的。
一個模型,是1953年Watson—Crick建立的DNA雙螺旋模型,這個模型從結(jié)構(gòu)上為DNA作為遺傳物質(zhì)提供了強有力的說明。他們提出的固定的堿基順序及嚴格的堿基配對原則所體現(xiàn)的特異性和恒定性是DNA具備遺傳信息的貯存和傳遞功能的分子基礎(chǔ)。所提出的由精確互補的雙鏈結(jié)構(gòu)所形成的雙螺旋三維立體構(gòu)象是遺傳信息的需要。這個模型的建立奠定了現(xiàn)代分子生物學(xué)的堅實基礎(chǔ)。
一個法則,是基因表達的中心法則,即DNA轉(zhuǎn)錄成RNA,RNA翻譯成蛋白質(zhì)。其中也存在著mRNA為模板進行的反向轉(zhuǎn)錄過程。
四個概念,是“復(fù)制”、“轉(zhuǎn)錄”、“翻譯”及“密碼子”的概念,指DNA的復(fù)制、RNA的轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)的翻譯及DNA中3個鄰近的核苷酸為特定的氨基酸編碼的信使RNA的密碼子。上述法則和概念不僅控制著一維遺傳信息的貯存和傳遞,也包含在三維信息的貯存和傳遞之中。核酸的一級結(jié)構(gòu)之所以重要是因為其分子特有的堿基順序決定了它攜帶的遺傳信息及行使的生物功能。